Home Epigenetics DNA Methyltransferase inhibitor RG108 (N-Phthalyl-L-Tryptophan)

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RG108 (N-Phthalyl-L-Tryptophan) DNMT Inhibitor

Réf. Catalogue: S2821

RG108 (N-Phthalyl-L-tryptophan) is an inhibitor of DNA methyltransferase with IC50 of 115 nM in a cell-free assay, does not cause trapping of covalent enzymes.
RG108 (N-Phthalyl-L-Tryptophan) DNA Methyltransferase inhibitor Chemical Structure

Structure chimique

Poids moléculaire: 334.33

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Contrôle Qualité (Quality Control)

Lot : Pureté : 99.82%
99.82

Culture cellulaire, traitement et concentration de travail
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Lignées cellulaires Type d'essai Concentration Temps d'incubation Formulation Description de l'activité PMID
human THP1 cells Function assay Inhibition of ACAT-mediated esterified cholesterol accumulation in human THP1 cells exposed to acetyl-LDL during differentiation assessed as effect on foam cell formation, IC50=1.5 μM 18620381
human HepG2 cells Function assay Inhibition of ACAT in human HepG2 cells, IC50=0.479 μM 19167888
rat macrophages Function assay 24 h Inhibition of ACAT in rat macrophages assessed as incorporation of extracellular [3H]-oleic acid-BSA complex into the intracellular cholesteryl ester after 24 hrs, IC50=0.479 μM 19464189
MCF7 Apoptosis assay 10 uM 6 hrs Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as apoptotic cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control 25801160
MCF7 Apoptosis assay 10 uM 6 hrs Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as dead cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control 25801160
MCF7 Function assay 100 uM 1 hr Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 100 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 30 mins and clicked with TER-PE 25801160
MCF7 Function assay 50 to 500 uM 1 hr Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 50 to 500 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 1 hr and clicked with TER 25801160
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
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Informations chimiques, stockage et stabilité (Chemical Information, Storage & Stability)

Poids moléculaire 334.33 Formule

C19H14N2O4

 Stockage (À compter de la date de réception)
N° CAS 48208-26-0 Télécharger le SDF Stockage des solutions mères

Synonymes N-Phthalyl-L-tryptophan Smiles C1=CC=C2C(=C1)C(=O)N(C2=O)C(CC3=CNC4=CC=CC=C43)C(=O)O

Solubilité (Solubility)

In vitro
Lot:

DMSO : 66 mg/mL (197.4 mM)
(Le DMSO contaminé par l'humidité peut réduire la solubilité. Utiliser du DMSO frais et anhydre.)

Ethanol : 66 mg/mL

Water : Insoluble

Calculateur de molarité

Masse Concentration Volume Poids moléculaire
Calculateur de dilution Calculateur de poids moléculaire

In vivo
Lot:

Calculateur de formulation in vivo (Solution claire)

Étape 1 : Saisir les informations ci-dessous (Recommandé : Un animal supplémentaire pour tenir compte des pertes pendant l'expérience)

mg/kg g μL

Étape 2 : Saisir la formulation in vivo (Ceci est seulement le calculateur, pas la formulation. Veuillez nous contacter d'abord s'il n'y a pas de formulation in vivo dans la section Solubilité.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Résultats du calcul :

Concentration de travail : mg/ml;

Méthode de préparation du liquide maître DMSO : mg médicament prédissous dans μL DMSO ( Concentration du liquide maître mg/mL, Veuillez nous contacter d'abord si la concentration dépasse la solubilité du DMSO du lot de médicament. )

Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, puis ajouterμL PEG300, mélanger et clarifier, puis ajouterμL Tween 80, mélanger et clarifier, puis ajouter μL ddH2O, mélanger et clarifier.

Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, puis ajouter μL Huile de maïs, mélanger et clarifier.

Note : 1. Veuillez vous assurer que le liquide est clair avant d'ajouter le solvant suivant.
2. Assurez-vous d'ajouter le(s) solvant(s) dans l'ordre. Vous devez vous assurer que la solution obtenue, lors de l'ajout précédent, est une solution claire avant de procéder à l'ajout du solvant suivant. Des méthodes physiques telles que le vortex, les ultrasons ou le bain-marie chaud peuvent être utilisées pour faciliter la dissolution.

Mécanisme d'action (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
DNA methyltransferase
(Cell-free assay)
115 nM
In vitro
RG108 bloque efficacement les DNA methyltransferases in vitro et ne provoque pas de piégeage enzymatique covalent dans les lignées cellulaires humaines. L'incubation de cellules avec de faibles concentrations micromolaires de ce composé entraîne une déméthylation significative de l'ADN génomique sans aucune toxicité détectable. Il est intéressant de noter qu'il provoque la déméthylation et la réactivation de gènes suppresseurs de tumeurs, mais n'affecte pas la méthylation des séquences satellites centromériques. Dans une autre étude, la synthèse et l'analyse in vitro d'un conjugué biotinylé de ce produit chimique sont étudiées pour évaluer les interactions avec les enzymes DNA methyltransferase. Dans une étude récente, il est montré que ce composé peut réduire significativement l'activité des DNA methyltransferases dans les cellules iPS dérivées de SM par rapport aux SM natifs.
Essai kinase
Test de méthylation in vitro
L'ADN substrat pour l'essai de méthylation in vitro est un fragment de 798 pb (−423/+375 par rapport au codon d'initiation) de la région promotrice du gène humain p16Ink4a. La réaction de méthylation contient 350 à 400 ng d'ADN substrat et 4 unités de méthylase M.SssI (0,5 μM) dans un volume final de 50 μL. Ce composé est ajouté à des concentrations finales de 10, 100, 200 et 500 μM, respectivement. Les réactions sont effectuées à 37 °C pendant 2 heures. Après achèvement, la réaction est inactivée à 65 °C pendant 15 minutes et l'ADN est purifié à l'aide d'un kit de purification PCR. Trois cents nanogrammes d'ADN purifié sont digérés pendant 3 heures à 60 °C avec 30 unités de BstUI et analysés sur des gels d'agarose Tris-borate EDTA à 2 %.
Références