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Decitabine DNA Methyltransferase inhibiteur

Réf. CatalogueS1200

La Decitabine est un inhibiteur de la DNA methyltransferase, s'incorporant à l'ADN et entraînant une hypométhylation de l'ADN et un arrêt de la réplication de l'ADN en phase intra-S. Elle est utilisée pour traiter le syndrome myélodysplasique (SMD). La Decitabine induit un arrêt du cycle cellulaire et l'apoptose dans diverses lignées de cellules cancéreuses.
Decitabine DNA Methyltransferase inhibiteur Chemical Structure

Structure chimique

Poids moléculaire: 228.21

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Contrôle Qualité

Lot : Pureté : 99.90%
99.90

Culture cellulaire, traitement et concentration de travail

Lignées cellulaires Type dessai Concentration Temps dincubation Formulation Description de lactivité PMID
Eca109 Function Assay 0.5 μM 24 h water modulates the gene expression of MAGE-A members 25123082
Eca109 Growth Inhibition Assay 0.5/2.5/5 μM 24/48/72 h water inhibits cell growth in both dose- and time- dependent manner 25123082
Eca109 Function Assay 0.5 μM 6/12/24 h water inhibits cell migration  25123082
Eca109 Function Assay 0.5 μM 24 h water inhibits cell invasion 25123082
Eca109 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 24 h water induces G2/M arrest in the cell cycle 25123082
Eca109 Function Assay 0.5/1 μM 24 h water decreases expression of NF-κB2 and MMP2 25123082
SW1116  Growth Inhibition Assay 0.5/1/2/5 μM 48 h DMSO enhances the Gefitinib induced cell inhibition 24874286
LOVO Growth Inhibition Assay 0.5/1/2/5 μM 48 h DMSO enhances the Gefitinib induced cell inhibition 24874286
SW1116  Function Assay 10 μM 48 h DMSO increases the effective at inhibiting AKT and mTOR signaling pathways combined with gefitinib 24874286
LOVO Function Assay 10 μM 48 h DMSO increases the effective at inhibiting AKT and mTOR signaling pathways combined with gefitinib 24874286
SW1116  Apoptosis Assay 10 μM 48 h DMSO enhances Gefitinib-induced apoptosis 24874286
LOVO Apoptosis Assay 10 μM 48 h DMSO enhances Gefitinib-induced apoptosis 24874286
RPMI-8226 Apoptosis Assay 1/2 μM 48/72/96 h DMSO induces cell apoptosis 24833108
OPM-2  Apoptosis Assay 1/2 μM 72/96/120 h DMSO induces cell apoptosis 24833108
JJN3  Apoptosis Assay 0.5/1 μM 24/48 h DMSO induces cell apoptosis 24833108
NCI-H929  Apoptosis Assay 1/2 μM 72/96/120 h DMSO induces cell apoptosis 24833108
RPMI-8226 Growth Inhibition Assay 1/2 μM 24/48/72 h DMSO affects cell cycle progression negatively 24833108
OPM-2  Growth Inhibition Assay 1/2 μM 24/48/72 h DMSO affects cell cycle progression negatively 24833108
JJN3  Growth Inhibition Assay 0.5/1 μM 24/48/72 h DMSO affects cell cycle progression negatively 24833108
NCI-H929  Growth Inhibition Assay 1/2 μM 24/48/72 h DMSO affects cell cycle progression negatively 24833108
HeLa Kinase Assay Ki=1000–5000 μM for hENT1 24780098
HeLa Kinase Assay Ki=5.6 ± 0.5 μM for hENT2 24780098
HeLa Kinase Assay Ki=21.6 ± 3.0 μM for hCNT1 24780098
HeLa Kinase Assay Ki=14.4 ± 4.6 μM for hCNT3 24780098
NB4 Function Assay 2.5/5/7.5/10 μM 24 h DMSO increasea the expression of precursor miR-125a 24484870
CD4+ CD25− T  Function Assay 1/5 μM reduceS global DNA methylation 24476360
BV-173 Apoptosis Assay 0.25/0.5/0.75/1 μM 48/72/96 h  PBS induces cell apoptosis in both dose- and time- dependent manner 24423613
ML-1 Apoptosis Assay 0.25/0.5/0.75/1 μM 48/72/96 h  PBS induces cell apoptosis in both dose- and time- dependent manner 24423613
HL-60 Apoptosis Assay 0.25/0.5/0.75/1 μM 48/72/96 h  PBS induces cell apoptosis in both dose- and time- dependent manner 24423613
KG-1a Apoptosis Assay 0.25/0.5/0.75/1 μM 48/72/96 h  PBS induces cell apoptosis in both dose- and time- dependent manner 24423613
BV-173 Function Assay 250/500nM 48 h  PBS induces delayed and sustained ROS increase 24423613
CEM Function Assay 250/500nM 48 h  PBS induces delayed and sustained ROS increase 24423613
HL-60 Function Assay 250/500nM 48 h  PBS induces delayed and sustained ROS increase 24423613
ML-1 Function Assay 250/500nM 48 h  PBS induces delayed and sustained ROS increase 24423613
DLD-1 Function Assay 250/500nM 48 h  PBS do not induces delayed and sustained ROS increase 24423613
HCT-116 Function Assay 250/500nM 48 h  PBS do not induces delayed and sustained ROS increase 24423613
U937-A/E-9/14/18  Apoptosis Assay 0.01/0.1/1/10 μM 48 h induces cell apoptosis in a dose-dependent manner 24300456
HT29 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=1400±179 μM 24172061
SW48 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=15.2±6.2 μM 24172061
HCT116 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=1.7±0.4 μM 24172061
HepG2 Function Assay 0.5/1 μM 24 h DMSO up-regulated the relative OCTN2 mRNA and protein expression 24146874
LS174T Function Assay 0.5/1 μM 24 h DMSO lead to an increase of OCTN2 levels 24146874
HepG2 Apoptosis Assay 1/10/100 μM 7 d DMSO induces cell apoptosis in a dose-dependent manner 24146874
LS174T Apoptosis Assay 1/10/100 μM 7 d DMSO induces cell apoptosis in a dose-dependent manner 24146874
QBC-939 Apoptosis Assay 1/10/100 μM 7 d DMSO induces cell apoptosis in a dose-dependent manner 24146874
U251 Apoptosis Assay 1/10/100 μM 7 d DMSO induces cell apoptosis in a dose-dependent manner 24146874
HL-60 Growth Inhibition Assay 1 μM 48 h increases G2-phase cell fraction 24000324
MDA‑MB‑453 Function Assay 0.2/1 μM 72 h causes re-expression of claudin 1  23844228
HCC1569 Function Assay 0.2/1 μM 72 h causes re-expression of claudin 1  23844228
BT‑474 Function Assay 0.2/1 μM 72 h causes re-expression of claudin 1  23844228
AGS Apoptosis Assay 5/10/20/50 μM 48 h  DMSO inhibits the cell viability  23582784
A549 Apoptosis Assay 5/10/20/50 μM 48 h  DMSO inhibits the cell viability  23582784
AGS  Growth Inhibition Assay 5/10/20/50 μM 48 h  DMSO induces G2/M phase arrest  23582784
Kasumi-1 Apoptosis Assay 0.5 μM 48 h  decreases the cell viability co-treated with Tf-NP-sc 23493348
OCI-AML3 Apoptosis Assay 2.5 μM 48 h  decreases the cell viability co-treated with Tf-NP-sc 23493348
MV4-11 Apoptosis Assay 2.5 μM 48 h  decreases the cell viability co-treated with Tf-NP-sc 23493348
NK  Cytotoxity Assay 0.02-20 μM 5 d decreases the cytolytic activity of NK cells at intermediate concentrations resulting in a U-shaped dose–response curve 23328088
NK  Apoptosis Assay 0.02-20 μM 5 d decrease NK cell proliferation and viability as the concentration increased 23328088
NK  Function Assay 0.01-20 μM 5 d causes hypomethylation of NK cells in a dose–response 23328088
MOLT4/DNR Function Assay 5 μM 4 d reduces ABCB1 mRNA expression 23060570
Jurkat/DOX Function Assay 5 μM 4 d reduces ABCB1 mRNA expression 23060570
MOLT4/DNR Growth Inhibition Assay 5 μM 4 d reduces the IC50 value for daunorubicin sensitivity 23060570
Jurkat/DOX Growth Inhibition Assay 5 μM 4 d reduces the IC50 value for daunorubicin sensitivity 23060570
ccRCC  Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO has minimal effect on cell proliferation 22826467
TNBC  Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO has minimal effect on cell proliferation 22826467
A498 Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO induces synergistic responses with romidepsin 22826467
KIJ265T Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO induces synergistic responses with romidepsin 22826467
MDA-231 Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO induces synergistic responses with romidepsin 22826467
BT-20 Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO induces synergistic responses with romidepsin 22826467
U937 Growth Inhibition Assay 5-20 μM 24/48/72 h induces a decrease in cell viability in a concentration- and time-dependent manner 22767021
HL60 Growth Inhibition Assay 5-20 μM 24/48/72 h induces a decrease in cell viability in a concentration- and time-dependent manner 22767021
U937 Apoptosis Assay 15 μM 24/48/72 h induces cell apoptosis 22767021
HL60 Apoptosis Assay 15 μM 24/48/72 h induces cell apoptosis 22767021
LS411N  Apoptosis Assay 0.5 μM 72 h increases Fas mRNA level 22461695
MDA-MB-231 Apoptosis Assay 10 μM 48 h reduces cell viability in a dose-dependent manner 21887697
MCF-7  Apoptosis Assay 10 μM 48 h reduces cell viability in a dose-dependent manner 21887697
A375 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
SKMEL1 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
SKMEL3 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
SKMEL28 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
MeWo Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
B16 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
Ly 1 Growth Inhibition Assay 24 h IC50=7.3 μM 21772049
Ly 7 Growth Inhibition Assay 24 h IC50=10.7 μM 21772049
Su-DHL6 Growth Inhibition Assay 24 h IC50>20 μM 21772049
Ly 10 Growth Inhibition Assay 24 h IC50>20 μM 21772049
RIVA Growth Inhibition Assay 24 h IC50>20 μM 21772049
Su-DHL2 Growth Inhibition Assay 24 h IC50>20 μM 21772049
Ly 1 Growth Inhibition Assay 48 h IC50=0.34 μM 21772049
Ly 7 Growth Inhibition Assay 48 h IC50=0.025 μM 21772049
Su-DHL6 Growth Inhibition Assay 48 h IC50>20 μM 21772049
Ly 10 Growth Inhibition Assay 48 h IC50=1.8 μM 21772049
RIVA Growth Inhibition Assay 48 h IC50>20 μM 21772049
Su-DHL2 Growth Inhibition Assay 48 h IC50=17.4 μM 21772049
Ly 1 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=0.01 μM 21772049
Ly 7 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=0.018 μM 21772049
Su-DHL6 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=1.6 μM 21772049
Ly 10 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=1.2 μM 21772049
RIVA Growth Inhibition Assay 72 h IC50>20 μM 21772049
Su-DHL2 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=11.2 μM 21772049
U373-MAGI Antiviral assay 0.25 to 8 uM 2 to 72 hrs Antiviral activity against VSV-G pseudotyped HIV-1 NL4-3 infected in human U373-MAGI cells assessed as reduction in U5-gag level at 0.25 to 8 uM after 2 to 72 hrs by qPCR method 27117260
U373-MAGI Antiviral assay 0.25 to 8 uM 2 to 72 hrs Antiviral activity against VSV-G pseudotyped HIV-1 NL4-3 infected in human U373-MAGI cells assessed as reduction in gag level at 0.25 to 8 uM after 2 to 72 hrs by qPCR method 27117260
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Informations chimiques, stockage et stabilité

Poids moléculaire 228.21 Formule

C8H12N4O4

Stockage (À compter de la date de réception)
N° CAS 2353-33-5 Télécharger le SDF Stockage des solutions mères

Synonymes Deoxycytidine, 5-aza-2'-deoxycytidine, 5-AZA-dC, 5-aza-CdR,NSC 127716 Smiles C1C(C(OC1N2C=NC(=NC2=O)N)CO)O

Solubilité

In vitro
Lot:

DMSO : 45 mg/mL (197.18 mM)
(Le DMSO contaminé par lhumidité peut réduire la solubilité. Utiliser du DMSO frais et anhydre.)

Water : 22.5 mg/mL

Ethanol : Insoluble

Calculateur de molarité

Masse Concentration Volume Poids moléculaire
Calculateur de dilution Calculateur de poids moléculaire

In vivo
Lot:

Calculateur de formulation in vivo (Solution claire)

Étape 1 : Saisir les informations ci-dessous (Recommandé : Un animal supplémentaire pour tenir compte des pertes pendant lexpérience)

mg/kg g μL

Étape 2 : Saisir la formulation in vivo (Ceci est seulement le calculateur, pas la formulation. Veuillez nous contacter dabord sil ny a pas de formulation in vivo dans la section Solubilité.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Résultats du calcul :

Concentration de travail : mg/ml;

Méthode de préparation du liquide maître DMSO : mg médicament prédissous dans μL DMSO ( Concentration du liquide maître mg/mL, Veuillez nous contacter dabord si la concentration dépasse la solubilité du DMSO du lot de médicament. )

Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, puis ajouterμL PEG300, mélanger et clarifier, puis ajouterμL Tween 80, mélanger et clarifier, puis ajouter μL ddH2O, mélanger et clarifier.

Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, puis ajouter μL Huile de maïs, mélanger et clarifier.

Note : 1. Veuillez vous assurer que le liquide est clair avant dajouter le solvant suivant.
2. Assurez-vous dajouter le(s) solvant(s) dans lordre. Vous devez vous assurer que la solution obtenue, lors de lajout précédent, est une solution claire avant de procéder à lajout du solvant suivant. Des méthodes physiques telles que le vortex, les ultrasons ou le bain-marie chaud peuvent être utilisées pour faciliter la dissolution.

Mécanisme daction

Targets/IC50/Ki
DNA methylation
(HL-60, KG1a cells)
In vitro

La Decitabine inhibe la croissance cellulaire de manière dose- et temps-dépendante avec des IC50 d'environ 438 nM et 43,8 nM pour des expositions de 72 heures et 96 heures dans les cellules leucémiques HL-60 et KG1a, respectivement. Une étude récente montre que ce composé présente une activité anti-proliférative et pro-apoptotique élevée contre le lymphome anaplasique à grandes cellules (LAGC), et inhibe l'incorporation de [3H]–thymidine dans les cellules KARPAS-299 avec une EC50 de 0,49 μM.

Essai kinase
dosage de synthèse d'ADN
Le taux de synthèse de l'ADN est mesuré par l'incorporation de thymidine radioactive dans l'ADN. Les cellules HL-60 et KG1a sont suspendues dans 2 mL de milieu RPMI contenant 10% de sérum fœtal dans des boîtes de 6 puits (35 mm de diamètre) et incubées avec différentes concentrations de médicaments correspondants pendant 48 heures (les médicaments sont ajoutés simultanément). À 48 heures, 0,5 μCi de [3H] thymidine (6,7 Ci/mmol) est ajouté à chaque puits et incubé pendant 24 heures supplémentaires. Les cellules sont placées sur des filtres en fibre de verre GF/C (2,4 cm de diamètre), lavées avec du NaCl froid à 0,9%, de l'acide trichloroacétique froid à 5% et de l'éthanol. Les filtres contenant l'ADN sont ensuite séchés, placés dans du liquide de scintillation EcoLite (ICN) et la radioactivité mesurée à l'aide d'un compteur à scintillation Beckman LS 6000IC. L'IC50 est définie comme la concentration de médicament qui inhibe 50% de la synthèse d'ADN des lignées de cellules leucémiques à partir de la courbe dose-réponse.
In vivo

Dans un modèle de xénogreffe murin ALK+ KARPAS-299, la Decitabine à une dose de 2,5 mg/kg entraîne une augmentation de l'apoptose et une réduction de la prolifération des cellules tumorales, et résulte également en une déméthylation du suppresseur de tumeur p16INK4A.

Références

Applications

Méthodes Biomarqueurs Images PMID
Western blot Survivin / Bcl-2 / p53 / c-Myc / DNMT1 p-AKT / AKT / p-GSK3β / GSK3β / p-Myc / Myc / p-P70 / P70 / p-4EBP-1 / 4EBP-1 / PTEN phospho-p38 / p38 / phospho-NFκB / NFκB p-JAK1 / JAK1 / p-JAK2 / JAK2 / p-STAT3 / STAT3 E-cadherin / N-cadherin / Snail / MMP-2 / MMP-9 / Bcl-2 / Bax
S1200-WB1
26384351
Immunofluorescence DNMT1 E-cadherin / MMP-9
S1200-IF1
21303982
Growth inhibition assay Cell viability
S1200-viability1
26384351

Informations sur lessai clinique

(données du https://clinicaltrials.gov, mis à jour le 2024-05-22)

Numéro NCT Recrutement Conditions Promoteur/Collaborateurs Date de début Phases
NCT06291285 Not yet recruiting
Healthy Volunteers
Novo Nordisk A/S
February 27 2024 Phase 1
NCT05960773 Recruiting
Mesothelioma|Malignant Mesothelioma (MM)|Early-stage Mesothelioma|Subclinical Mesothelioma|BRCA1-Associated Protein-1 (BAP1) Mutations|Early-stage BAP1-associated Malignancies
National Cancer Institute (NCI)|National Institutes of Health Clinical Center (CC)
January 31 2024 Phase 2
NCT05835011 Terminated
Myelodysplastic Syndromes
Astex Pharmaceuticals Inc.
July 14 2023 Phase 2
NCT05816356 Recruiting
Healthy
EpiDestiny Inc.|Worldwide Clinical Trials
March 24 2023 Phase 1

Support technique

Instructions de manipulation

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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Foire aux questions

Question 1:
Is it a racemic mixture or a monomer?

Réponse :
Its S1200 is R form.